集团自2013年开始组建高通量测序平台，严格按照国家卫计委对高通量测序实验室的要求进行规范。该平台定位于科研与临床公共服务应用，与合同单位开放共享。2014年11月由南方医科大学与广州华银医学检验中心有限公司共同成立南方医科大学生物医学大数据研究中心（Bio Med Big Data Center, BMDC），该中心是专注于生物医学大数据的信息采集、研究分析、提取整合、应用转化的公共服务平台。BMDC紧密依托南方医科大学的大规模模式生物、微生物中心和临床资源集成的生物学平台，以及集团先进的高通量测序技术平台。在丁彦青、徐湘民、张镇海、张文清、李金明、周宏伟等权威专家的带领下，汇聚了全国高通量测序及生物信息分析资深研究学者，形成了覆盖医学遗传学、病理学、临床医学、模式生物学、微生物学、生物信息学、卫生统计学等众多领域的强大专家团队。
新一代测序技术帮助众多科研人员取得了举世瞩目的研究成果，而随之产生的海量数据使众多研究者面临考验。基于二代测序的生物医学大数据研究中心，致力于突破二代测序所面临的数据分析等挑战。BMDC围绕地中海贫血和白血病、出生缺陷性疾病、慢性肾病和肝炎、神经性疾病、大肠癌、消化系统疾病，对超大人群体检样本库进行易感基因、分子标记物筛查、大规模遗传学生物突变体筛选等研究，以进一步研究发病机制、风险预警、早期诊断和干预、治疗策略。
