目前，集团中心拥有Illumina NextSeq 500、HiSeq 3000、MiSeq和Ion torrent等高通量测序仪组成的大规模高通量测序服务平台，可以提供涵盖基因组学、转录组学、表观遗传学、免疫组学、蛋白质组学等各种测序服务和高级生物信息分析服务。
NextSeq 500和MiSeq是Illumina公司医学领域主流的测序平台组合。NextSeq 500能够在高产量运行模式和快速周转运行模式下灵活转换，两者的数据产量分别为30G、120G。MiSeq系统能够在8小时内从起始样本得到分析数据，是唯一一台集扩增、测序和数据分析于一身的新一代测序仪，每次运行能产生7G数据。Ion torrent平台是基于半导体技术的台式高通量测序仪，能根据反应池中的PH的变化快速“读”出DNA序列，具有简单、快速、准确、灵活和低成本等显著优势。
